Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fv4P11370 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fv4P11370 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fv4P11370 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms