Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P10404 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P10404 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P10404 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P10404 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P10404 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P10404 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P10404 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P10404 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P10404 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms