Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb4P10284 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb4P10284 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxb4P10284 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxb4P10284 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms