Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myod1P10085 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Myod1P10085 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms