Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf1P07141 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms