Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprcP06800 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprcP06800 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprcP06800 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PtprcP06800 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprcP06800 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprcP06800 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprcP06800 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms