Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa4P06798 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa4P06798 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa4P06798 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms