Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06330 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06330 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06330 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06330 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06330 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06330 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06330 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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