Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06323 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06323 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06323 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06323 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06323 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06323 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06323 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06323 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06323 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06323 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06323 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06323 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06323 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06323 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms