Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa7P02830 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms