Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01915 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01915 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01915 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01915 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01915 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01915 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01915 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01915 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms