Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-LP01897 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-LP01897 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms