Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01822 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01822 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01822 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01822 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01822 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01822 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01822 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01822 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01822 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P01822 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms