Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01801 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01801 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01801 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01801 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01801 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01801 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01801 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01801 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01801 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01801 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01801 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms