Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01798 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01798 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01798 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01798 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01798 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01798 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01798 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01798 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01798 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms