Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01727 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01727 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01727 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01727 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01727 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01727 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01727 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01727 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01727 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01727 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01727 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms