Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4bP01029 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4bP01029 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4bP01029 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4bP01029 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4bP01029 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4bP01029 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4bP01029 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4bP01029 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4bP01029 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4bP01029 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C4bP01029 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4bP01029 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4bP01029 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C4bP01029 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4bP01029 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms