Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccl20O89093 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ccl20O89093 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ccl20O89093 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Ccl20O89093 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ccl20O89093 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl20O89093 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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