Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apaf1O88879 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apaf1O88879 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apaf1O88879 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms