Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pak1O88643 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pak1O88643 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pak1O88643 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pak1O88643 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pak1O88643 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pak1O88643 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak1O88643 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak1O88643 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pak1O88643 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms