Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme6O88425 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme6O88425 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme6O88425 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms