Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid2O88322 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nid2O88322 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nid2O88322 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
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