Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfdp1O88271 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfdp1O88271 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms