Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clec11aO88200 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec11aO88200 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec11aO88200 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms