Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb5O70309 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb5O70309 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms