Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sap18O55128 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sap18O55128 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sap18O55128 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sap18O55128 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms