Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp26a1O55127 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp26a1O55127 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms