Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp10O55123 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp10O55123 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp10O55123 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms