Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SlkO54988 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SlkO54988 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SlkO54988 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SlkO54988 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SlkO54988 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SlkO54988 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SlkO54988 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SlkO54988 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SlkO54988 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SlkO54988 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SlkO54988 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms