Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TsksO54887 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TsksO54887 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TsksO54887 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TsksO54887 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TsksO54887 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TsksO54887 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TsksO54887 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TsksO54887 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TsksO54887 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TsksO54887 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TsksO54887 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TsksO54887 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TsksO54887 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TsksO54887 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TsksO54887 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TsksO54887 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TsksO54887 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TsksO54887 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TsksO54887 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TsksO54887 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TsksO54887 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms