Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DffaO54786 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DffaO54786 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DffaO54786 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DffaO54786 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DffaO54786 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DffaO54786 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DffaO54786 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DffaO54786 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DffaO54786 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DffaO54786 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DffaO54786 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DffaO54786 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DffaO54786 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DffaO54786 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DffaO54786 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DffaO54786 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DffaO54786 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DffaO54786 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms