Protein–RNA interactions for Protein: O35972

Mrpl23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl23O35972 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl23O35972 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl23O35972 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.4 ms