Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bnc1O35914 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bnc1O35914 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms