Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops5O35864 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops5O35864 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops5O35864 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops5O35864 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops5O35864 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cops5O35864 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cops5O35864 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops5O35864 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops5O35864 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms