Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1aO35526 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms