Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edil3O35474 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edil3O35474 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edil3O35474 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Edil3O35474 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms