Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt1O35449 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt1O35449 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms