Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna6O35345 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms