Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfsf11O35235 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf11O35235 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf11O35235 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms