Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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