Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GclmO09172 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GclmO09172 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GclmO09172 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GclmO09172 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GclmO09172 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GclmO09172 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GclmO09172 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GclmO09172 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GclmO09172 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GclmO09172 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GclmO09172 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GclmO09172 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GclmO09172 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GclmO09172 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GclmO09172 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GclmO09172 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GclmO09172 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GclmO09172 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms