Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casq1O09165 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms