Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm3488M0QW81 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3488M0QW81 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3488M0QW81 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms