Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm6871L7N248 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm6871L7N248 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6871L7N248 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm6871L7N248 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6871L7N248 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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