Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1oL7MU04 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1oL7MU04 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms