Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21900J3QP38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm21900J3QP38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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