Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20825J3QM67 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20825J3QM67 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms