Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm6594J3QM43 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm6594J3QM43 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm6594J3QM43 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm6594J3QM43 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm6594J3QM43 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm6594J3QM43 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm6594J3QM43 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm6594J3QM43 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm6594J3QM43 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm6594J3QM43 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm6594J3QM43 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm6594J3QM43 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6594J3QM43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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