Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20815J3KMI0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20815J3KMI0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms