Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zkscan2G3X952 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zkscan2G3X952 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan2G3X952 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan2G3X952 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan2G3X952 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms